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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
18/01/2008 |
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Data da última atualização: |
21/10/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FIGUEIREDO, R. de O.; WATRIN, O. dos S.; GERHARD, P.; KATO, O. R.; SOUZA, E. L.; OLIVEIRA, F. de A.; PESSOA, M. C. P. Y.; LIMA, L. M.; COSTA, F. F.; ROSA, M. B. S. da; CORRÊA, J. M.; PINHEIRO, R. da S.; SILVA, M. da G. M. da; CAMPINAS, D.; CRUZ, F. M.; ROSA, G. H. S. da. |
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Afiliação: |
RICARDO DE OLIVEIRA FIGUEIREDO, CPATU; ORLANDO DOS SANTOS WATRIN, CPATU; PEDRO GERHARD, CPATU; OSVALDO RYOHEI KATO, CPATU; Eliene Lopes Souza, UFPA; Francisco de Assis Oliveira, UFRA; MARIA CONCEICAO PERES YOUNG PESSOA, CNPMA; Lilianne Maia Lima, CPATU; Fabíola Fernandes Costa, CPATU; Maria Beatriz Silva da Rosa, CPATU; Jean Michel Corrêa, CPATU; Roberta da Silva Pinheiro, UFRA; Marília das Graças Mesquita da Silva, UFPA; Danille Campinas, CPATU; Fábio Monteiro Cruz, UEPA; Gustavo Henrique Silva da Rosa, UFPA. |
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Título: |
Watershed studies in a region mainly occupied by small holder farms in the eastern Amazon. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SCIENCE TEAM MEETING, 11., 2007, Salvador. Book of Abstracts... Manaus: LBA-ECO, 2007. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Abstract ID: 71. |
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Palavras-Chave: |
Bacias hidrográficas; Brasil. |
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Thesagro: |
Agricultura Familiar; Água; Bacia Hidrográfica. |
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Thesaurus Nal: |
Amazonia; Watersheds. |
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Categoria do assunto: |
--
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/42292/1/ID39631.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/103597/1/2007RA-035.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Café. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
14/03/2017 |
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Data da última atualização: |
14/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
MOTTA, L. B. |
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Afiliação: |
LUDYMILA BRANDÃO MOTTA. |
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Título: |
Genotipagem por sequenciamento para identificação de SNPs e associação com características agronômicas em Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
2016. |
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Páginas: |
159 f. |
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Descrição Física: |
il. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (doutorado em Produção vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. Orientadora: Taís Cristina Bastos Soares. Coorientadores: Maria Amélia Gava Ferrão, Alan Carvalho Andrade, Cosme Damião Cruz. |
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Conteúdo: |
A genotipagem por sequenciamento (GBS) é capaz de identificar e genotipar milhares de polimorfismos do tipo SNPs de forma simultânea. Objetiva-se contribuir para o melhoramento genético do cafeeiro Conilon através da caracterização da ocorrência de SNPs no genoma de Coffea canephora e de associações destes com características de interesse agronômico. Os145 indivíduos de duas famílias de irmãos completos (clones 109x120/120x109 e 76x48) do programa de melhoramento do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (Incaper)foram fenotipados e os DNAs foram multiplexados em sequenciador Ilumina na Universidade de Cornell. Detectaram-se 91.105 SNPs antes de aplicar os parâmetros de filtragem, sendo que após os filtros houve redução de 64%. Ampla distribuição dos SNPs foi encontrada, sendo que foram detectados em média 1330 SNPs gênicos e 2955 intergênicos, por pseudocromossomo. Verificou-se que o padrão de distribuição dos SNPs nas regiões do genoma difere. A menor ocorrência de SNPs detectada em regiões gênicas é esperada como consequência da pressão de seleção, que limita as alterações de aminoácidos nas sequências proteicas. Os estudos de associação permitiram encontrar 18 SNPs associados a características fenotípicas de Coffea canephora (S2_9329731, S2_4579518, S2_41329025, S2_17821870, S2_20934616, S3_23227842, S4_22978689, S5_10964474, S6_9949547, S7_13991105, S7_13991086, S7_13991077, S9_4618814, S9_18527411, S10_24840747, S11_30063996, S11_23828233). Localizam-se em regiões intergênicas 33% dos SNPs, sendo que os demais se distribuem em região de íntrons, éxons e 3?UTR. Os SNPs em região codificadora são responsáveis por alterações não sinônimas em 82% das ocorrências. Os resultados encontrados são importantes para a cafeicultura e podem contribuir para a seleção assistida por marcadores. MenosA genotipagem por sequenciamento (GBS) é capaz de identificar e genotipar milhares de polimorfismos do tipo SNPs de forma simultânea. Objetiva-se contribuir para o melhoramento genético do cafeeiro Conilon através da caracterização da ocorrência de SNPs no genoma de Coffea canephora e de associações destes com características de interesse agronômico. Os145 indivíduos de duas famílias de irmãos completos (clones 109x120/120x109 e 76x48) do programa de melhoramento do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (Incaper)foram fenotipados e os DNAs foram multiplexados em sequenciador Ilumina na Universidade de Cornell. Detectaram-se 91.105 SNPs antes de aplicar os parâmetros de filtragem, sendo que após os filtros houve redução de 64%. Ampla distribuição dos SNPs foi encontrada, sendo que foram detectados em média 1330 SNPs gênicos e 2955 intergênicos, por pseudocromossomo. Verificou-se que o padrão de distribuição dos SNPs nas regiões do genoma difere. A menor ocorrência de SNPs detectada em regiões gênicas é esperada como consequência da pressão de seleção, que limita as alterações de aminoácidos nas sequências proteicas. Os estudos de associação permitiram encontrar 18 SNPs associados a características fenotípicas de Coffea canephora (S2_9329731, S2_4579518, S2_41329025, S2_17821870, S2_20934616, S3_23227842, S4_22978689, S5_10964474, S6_9949547, S7_13991105, S7_13991086, S7_13991077, S9_4618814, S9_18527411, S10_24840747, S11_30063996, S11_23828233)... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Estudo de associação; Genotipagem; Polimorfismo de nucleotídeo único; Sequenciamento de nucleotídeo. |
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Thesagro: |
Café. |
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Thesaurus NAL: |
Coffea; Genotyping; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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500 $aTese (doutorado em Produção vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. Orientadora: Taís Cristina Bastos Soares. Coorientadores: Maria Amélia Gava Ferrão, Alan Carvalho Andrade, Cosme Damião Cruz.
520 $aA genotipagem por sequenciamento (GBS) é capaz de identificar e genotipar milhares de polimorfismos do tipo SNPs de forma simultânea. Objetiva-se contribuir para o melhoramento genético do cafeeiro Conilon através da caracterização da ocorrência de SNPs no genoma de Coffea canephora e de associações destes com características de interesse agronômico. Os145 indivíduos de duas famílias de irmãos completos (clones 109x120/120x109 e 76x48) do programa de melhoramento do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (Incaper)foram fenotipados e os DNAs foram multiplexados em sequenciador Ilumina na Universidade de Cornell. Detectaram-se 91.105 SNPs antes de aplicar os parâmetros de filtragem, sendo que após os filtros houve redução de 64%. Ampla distribuição dos SNPs foi encontrada, sendo que foram detectados em média 1330 SNPs gênicos e 2955 intergênicos, por pseudocromossomo. Verificou-se que o padrão de distribuição dos SNPs nas regiões do genoma difere. A menor ocorrência de SNPs detectada em regiões gênicas é esperada como consequência da pressão de seleção, que limita as alterações de aminoácidos nas sequências proteicas. Os estudos de associação permitiram encontrar 18 SNPs associados a características fenotípicas de Coffea canephora (S2_9329731, S2_4579518, S2_41329025, S2_17821870, S2_20934616, S3_23227842, S4_22978689, S5_10964474, S6_9949547, S7_13991105, S7_13991086, S7_13991077, S9_4618814, S9_18527411, S10_24840747, S11_30063996, S11_23828233). Localizam-se em regiões intergênicas 33% dos SNPs, sendo que os demais se distribuem em região de íntrons, éxons e 3?UTR. Os SNPs em região codificadora são responsáveis por alterações não sinônimas em 82% das ocorrências. Os resultados encontrados são importantes para a cafeicultura e podem contribuir para a seleção assistida por marcadores.
650 $aCoffea
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650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aCafé
653 $aEstudo de associação
653 $aGenotipagem
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653 $aSequenciamento de nucleotídeo
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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